論文に必要な解析が簡単にできるRNA-Seqデータ解析ツール
こんな方にオススメ！
RNA-Seqデータ解析を実施したい方で以下のような方にオススメです。
✔︎ 外部委託や共同研究者への依頼は行いたくない
✔︎ 自分で解析手法を勉強する時間がない
✔︎ 他社のソフトウェアを試したが操作が難しいと感じた
簡単にRNA-Seqのデータ解析を行えます
生データ（FASTQファイル/公共データ）から遺伝子発現量の定量を行う例
概要
論文に必要な解析が簡単にできるRNA-Seqデータ解析ツールです。 Linuxのコマンド操作やバイオインフォマティクスの知識は不要です。 また、クラウド上で解析を行いますので、スペックが高いパソコンの準備も不要です。
RNA-Seq解析の生データ（FASTQファイル/公共データ）もしくは発現量テーブル(CSV / TSVファイル)からスタートして、遺伝子発現量の定量、発現変動遺伝子抽出(DEG解析)、Volcano plot描画、MAプロット描画、ヒートマップ描画、GO解析、パスウェイ解析等を実施できます。
機能
遺伝子発現量の定量
生データ（FASTQファイル/公共データ）から遺伝子発現量を算出します。
発現変動遺伝子抽出(DEG解析)
グループ間で発現量に変化があった遺伝子をリストアップします。
ヒートマップ
遺伝子発現データを視覚化した図です。クラスタリングも同時に実施して似ている遺伝子を近くに配置します。
Volcano plot
横軸に発現量の変化、縦軸に統計的有意性をプロットした図です。
主成分分析（PCA）
主成分分析によりサンプル間の類似度を表現します。
階層的クラスタリング
階層的クラスタリングによりサンプル間の類似度を表現します。
MAプロット(MA plot)
横軸に平均発現量、縦軸に発現量の変化をプロットした図です。
GO解析
発現変動遺伝子に多く見られるGene Ontologyを検出します。
パスウェイ解析
発現変動遺伝子に多く見られるパスウェイを検出します。
データの共有
メールアドレスを入力するだけで、データを共有できます。
料金
サブスクリプション登録するとすべての機能が利用可能になります。 現在7日間の無償トライアルを実施中です。
| 当社ツール | 他社製品 | 受託 | |
| 価格 | 7日間無償 年間プラン: 15,700円/年（1,308円/月） 月間プラン: 3,100円/月 | 年間数十万円 | １解析あたり数万円〜数十万円 |
|---|---|---|---|
| PCの準備 | 不要 | 要 | 不要 |
| パラメータ | 自由に設定可能 | 自由に設定可能 | 業者による指定 |
| 納期 | 今すぐご利用いただけます | 営業に問い合わせ | 数日〜数週間 |
よくある質問
操作方法や解析内容についてサポートはあるか？
お困りのことがある場合には、お気軽にお問い合わせください。
遺伝子発現量の定量の結果として得られる発現量テーブルとは？
それぞれの遺伝子ごとにマッピングされたリードの数を出力した表です。生のカウントデータおよび補正後のTPMの値がダウンロード可能です。
アップロードできるファイル形式は？
生データとしてFASTQファイル(圧縮なし/gzip圧縮)、発現量テーブルとしてCSV/TSVファイルをアップロードできます。
領収書はもらえるか？
メールにて領収書を送付いたします。
対応生物種は？
ヒト、マウス、ラットに対応しています。
内部で動いているソフトウェアは？
Salmon、edgeR、clusterProfilerを使用しています。