【RaNA-seqの使い方】RNA-Seqのデータ解析

RaNA-seqはRNA-Seqのデータ解析をブラウザ上で行うことができるツールです。 FASTQファイルからスタートして、発現変動遺伝子の抽出や機能解析を実施することができます。 本ページではRaNA-seqの使い方を紹介します。RaNA-seqは無料で使用することができますが、サーバーが安定しなかったり、使いづらい部分もありますので、 代替手段を探している方は弊社にて提供してるRNA-Seqデータ解析ツールもご検討ください。

メニューの「Analysis」をクリックすると、以下のようなユーザー登録の画面が表示されます。 「Anonymous access」からログインせずに開始することもできます。

ログインをすると以下のような画面が表示されます。 「Reference genome assembly」のところで参照配列を選択して、「Sequencing type」でシングルエンドかペアエンドかを選択してから、 「Select your FASTQ Files」のところでFASTQファイルをアップロードします。 FASTQファイルのサイズによってはアップロードに時間がかかります。

アップロードが終わってから以下の画面の「Quality Control」をクリックすると、QC結果が確認できます。

Boxplotの他にも、Barplot、Heatmap、PCAplot等が閲覧できます。

アップロードが終わってから「Analysis」をクリックすると、以下のような設定画面が表示されます。

「Results」をクリックすると、以下のような画面が表示され、しばらくするとそれぞれの結果が閲覧できるようになります。